虽然防范恶意软件最常用只有一个方法安装杀毒软件。 也使用其他替代方案，包括： UTM（ Unified Threat Management ），硬件和网络防火墙、 基于云计算的杀毒软件和在线扫描仪。

硬件和网络防火墙

网络防火墙：阻止未知的程序和流程访问系统。 然而，他们不防病毒系统和没有试图识别或删除任何东西。 他们可能从外面受保护的计算机或防止感染 网络 ,并限制任何恶意软件存在的活动通过阻断传入或传出请求特定的TCP / IP端口。 防火墙的目的是处理更广泛的系统威胁来自网络连接到系统，不是一个替代病毒防护系统。

云杀毒

云杀毒软件是一种技术，它使用轻量级的代理软件保护电脑，而把大部分的数据分析提供者的基础设施。

一个方法来实现云杀毒需要使用多个杀毒引擎扫描可疑文件。 早期提出的这种方法是实现云杀毒的概念称为CloudAV。 CloudAV是为了发送程序或文档 网络云 同时使用多个杀毒和行为检测程序，为了提高检测率。 平行扫描的文件可能使用不兼容的杀毒扫描是通过每个探测引擎生成一个虚拟机，因此消除任何可能的问题。 CloudAV还可以执行“回顾性检测”，即云探测引擎重新扫描所有文件的文件访问历史当一个新的威胁识别从而提高新的威胁检测速度。 最后，CloudAV是解决方案有效的病毒扫描设备上，缺乏执行扫描自己的计算能力。

云杀毒产品的一些例子 熊猫云杀毒 和 Immunet 。

在线扫描

一些反病毒厂商维护网站免费在线扫描整个计算机能力，关键领域，本地磁盘、文件夹或文件。 定期在线扫描是一个好主意对于那些在电脑上运行防病毒应用程序，因为这些应用程序通常是缓慢的威胁。 的第一件事，恶意软件的攻击是禁用任何现有的杀毒软件，有时攻击的唯一办法知道是转向一个在线资源，受感染的电脑上没有安装。

专业的工具

命令行 rkhunter 扫描仪，扫描引擎 Linux rootkit 。 这里上运行该工具 Ubuntu 。

病毒清除工具可以帮助去除顽固感染或某些类型的感染。 例子包括 趋势科技 的 Rootkit克星 ,   rkhunter 的检测 rootkit , 小红伞的杀毒软件删除工具 ,  电脑工具软件威胁删除工具 , 和 AVG 2011年的免费杀毒软件。

救援盘引导，如CD或USB存储设备，可用于外运行杀毒软件已安装的操作系统，为了消除感染时休眠状态。 启动杀毒软件磁盘可能是有用的，例如，安装操作系统不再是引导或抵制一切试图删除的恶意软件安装的杀毒软件。 的例子，其中一些包括引导磁盘 小红伞 小红伞救援体（ 137年 ] 电脑工具软件 替代操作系统扫描器 , （ 140年 ] 和 AVG 救援CD 。 （ 141年 ] AVG营救光盘软件也可以安装到一个USB存储设备，可引导的新电脑。 （ 141年 ]